Marek Hovorka se narodil v Dubnici nad Váhom. Do slovenské extraligy naskočil v barvách Martinu, odkud se v létě 2004 přesunul do Liptovského Mikuláše. V podhůří Vysokých Tater strávil téměř čtyři sezony, než na závěr ročníku 2007/2008 posílil Ústecké Lvy, jimž však k záchraně v české nejvyšší soutěži nepomohl.

Na čas se pak vrátil ještě na Slovensko, kde nastupoval za Martin a Dolný Kubín, ovšem v závěru sezony 2008/2009 se definitivně přesunul do českých soutěží. S Ústeckými Lvy se ještě dvakrát pokoušel o návrat mezi tuzemskou elitu, než se v průběhu ročníku 2010/2011 přesunul do Kladna.

V dresu Rytířů zažil velmi povedený následující ročník, během nějž čtrnáctkrát skóroval a přidal 18 asistencí, což jej katapultoval až na mistrovství světa 2012 ve Švédsku a Finsku, kde Slováci v semifinále vyřadili český tým a získali stříbro. Svými výkony si Marek Hovorka řekl o angažmá v pražské Spartě, odkud v sezoně 2013/2014 hostoval v Karlových Varech. Poté přišel k Pirátům a v cestě za návratem do extraligy vyhrál klubovou produktivitu v základní části první ligy i v baráži, jen v play-off skončil třetí za Ondřejem Kašem a Štěpánem Hřebejkem. Nejvyšší soutěž však v Chomutově nedokončil, v průběhu ročníku se přesunul do Vítkovic.

Statistiky

Sezóna   Klub                                            Z  G  A   B  TM
2003-04  MHC Martin (SVK)                               48  5  8  13  16
2004-05  MHK 32 Liptovský Mikuláš (SVK)                 54  6  6  12  16
2005-06  MHK 32 Liptovský Mikuláš (SVK)                 52  8  5  13  28
2006-07  MHK 32 Liptovský Mikuláš (SVK)                 53 11 26  37  76
2007-08  MHK 32 Liptovský Mikuláš (SVK)                 43  9 12  21  54
         HC Slovan Ústečtí Lvi (E)                       4  0  0   0   0
         HC Slovan Ústečtí Lvi (E, p-out)               12  2  1   3   2
         HC Slovan Ústečtí Lvi (baráž)                   4  3  0   3   6
2008-09  MHC Martin (SVK)                               31  5  6  11  51
         HC Slovan Ústečtí Lvi (1. liga)                12  5  4   9   8
         HC Slovan Ústečtí Lvi (1. liga, p-o)           17  3  4   7  35
         HC Slovan Ústečtí Lvi (baráž)                   4  0  0   0   2
2009-10  BK Mladá Boleslav (E)                           2  0  0   0   0
         HC Slovan Ústečtí Lvi (1. liga)                26  6  7  13  22
         HC Slovan Ústečtí Lvi (1. liga, p-o)           14  2 11  13  92
2010-11  HC Vagnerplast Kladno (E)                      13  1  1   2   2
         HC Vagnerplast Kladno (E, p-out)                7  3  3   6   2
         HC Slovan Ústečtí Lvi (1. liga)                21  3  3   6  22
2001-12  Rytíři Kladno (E)                              52 14 18  32  42
         Rytíři Kladno (E, p-o)                          3  1  0   1   4
2012-13  Rytíři Kladno (E)                              12  4  0   4   6
         HC Sparta Praha (E)                            40  8 13  21  22
         HC Sparta Praha (E, p-o)                        6  0  1   1   6
2013-14  HC Energie Karlovy Vary (E)                    43  7 15  22  46
2014-15  Piráti Chomutov (1. liga)                      49 26 28  54  66
         Piráti Chomutov (1. liga, p-o)                 11  3  7  10  42
         Piráti Chomutov (baráž)                        11  5  6  11   2
2015-16  Piráti Chomutov (E)                            22  2  2   4   2
         HC VÍTKOVICE STEEL (E)                         28  6  4  10  44
         HC VÍTKOVICE STEEL (E, p-out)                   6  2  2   4   2
Celkem za Chomutov                                      93 36 43  79 112
Celkem v extralize                                     250 50 60 110 180

Reprezentace:
2011-12  MS (FIN, SWE - Helsinky, Stockholm) - stříbro   4  0  0   0   2